Las funciones principales de la Fiscalía son prestar asesoría jurídica integral a las demás Direcciones y Departamentos de la Comisión; asegurar la regularidad, transparencia y probidad de la gestión interna, controlando la correspondencia entre las decisiones institucionales con la normativa vigente; velar por el cabal cumplimiento de las leyes de Compras Públicas, Lobby y Transparencia, y representar judicial y administrativamente los intereses de la Institución.